వంశపారంపర్య జన్యుశాస్త్రం: ప్రస్తుత పరిశోధన

నైరూప్య

అబియోటిక్ ఒత్తిడి పరిస్థితులలో డెండ్రోబియం అఫిషినేల్ యొక్క టై1-కోపియా గ్రూప్ రెట్రోట్రాన్స్‌పోజన్స్ యాక్టివేషన్

కాంగ్ లి, యువాన్ జియాంగ్, యాన్హుయ్ గావో, జిన్‌పింగ్ సి

యూనివర్సల్ ప్రైమర్ టై1-కోపియా రెట్రోట్రాన్స్‌పోసన్ రివర్స్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టేజ్ (RT)ని ఉపయోగించడం ద్వారా, కోల్డ్ స్ట్రెస్ మరియు ఓస్మోటిక్ స్ట్రెస్ ద్వారా ప్రేరేపించబడిన దాదాపు 260 bp యొక్క సంరక్షించబడిన రివర్స్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టేజ్ డొమైన్, ఈ అధ్యయనంలో డెండ్రోబియం అఫిసినేల్ నుండి RTPCR ద్వారా విస్తరించబడింది, ఇది రెట్రోపాసన్‌ని సూచిస్తుంది. ఒత్తిడి పరిస్థితుల ద్వారా సక్రియం చేయవచ్చు. సంబంధిత బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ సాఫ్ట్‌వేర్ ద్వారా సీక్వెన్సింగ్ మరియు విశ్లేషించడం కోసం యాంప్లికాన్‌లు తిరిగి పొందబడ్డాయి మరియు క్లోన్ చేయబడ్డాయి. 78 Ty1-copia వంటి రెట్రోట్రాన్స్‌పోసన్ RTలు ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్‌గా యాక్టివేట్ చేయబడ్డాయి, అధిక వైవిధ్యతతో పొందబడ్డాయి. ఈ సీక్వెన్స్‌ల పొడవు 245 నుండి 265 bp వరకు ఉంటుంది, అన్ని సీక్వెన్స్‌లు ATలో సమృద్ధిగా ఉన్నాయి మరియు హోమోలజీ 42.9% నుండి 99.2% వరకు ఉన్నాయి. CAAT బాక్స్, TATA బాక్స్ సంరక్షించబడిన సీక్వెన్సులు మరియు కొన్ని ఇతర నియంత్రణ మూలకాలకు అనుగుణంగా, ఒత్తిడి పరిస్థితులు మరియు ప్రారంభ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ సిగ్నల్‌ల ద్వారా ప్రేరేపించబడిన వివిధ సిస్-యాక్టింగ్ రెగ్యులేటరీ ఎలిమెంట్స్ ఆఫ్ జీనోమ్, రెట్రోట్రాన్స్‌పోసన్ RT వంటి Ty1-copiaకి సమానంగా ఉంటుంది. Ty1-copia రెట్రోట్రాన్స్‌పోజన్‌ల యొక్క రివర్స్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టేజ్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్‌గా యాక్టివేట్ చేయబడిన ఒత్తిడి పరిస్థితుల ద్వారా ప్రేరేపించబడిన సిస్-యాక్టింగ్ రెగ్యులేటరీ ఎలిమెంట్‌లు, జన్యువు యొక్క రెట్రోట్రాన్స్‌పోసన్ RT వంటి Ty1-copia కంటే గణనీయంగా పెంచబడ్డాయి. అమైనో ఆమ్లాలలోకి అనువదించబడినప్పుడు, కొన్ని సీక్వెన్సులు స్టాప్ కోడాన్ మ్యుటేషన్ లేదా/మరియు ఫ్రేమ్‌షిఫ్ట్ మ్యుటేషన్‌ను అందించాయి మరియు అన్ని సీక్వెన్సులు సంరక్షించబడిన సీక్వెన్స్ "SLYGKQ"లో మ్యుటేషన్‌ను అందించాయి. వారి అమైనో ఆమ్ల శ్రేణుల అమరిక విశ్లేషణల తర్వాత ఫైలోజెనిక్ విశ్లేషణ ద్వారా నాలుగు వర్గాలు గుర్తించబడ్డాయి మరియు తక్కువ హోమోలజీని కలిగి ఉన్న జీనోమ్ యొక్క రెట్రోట్రాన్స్‌పోసన్ RT వంటి Ty1-కోపియాతో, ఇది ఒత్తిడి పరిస్థితులలో ప్రేరేపించబడిన Ty1-కోపియా రెట్రోట్రాన్స్‌పోజన్‌లను రివర్స్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టేజ్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్‌గా యాక్టివేట్ చేసిందని సూచించింది. Ty1-copia వంటి వాటితో గణనీయంగా తేడాలు ఉన్నాయి జన్యువు యొక్క రెట్రోట్రాన్స్పోసన్ RT.