జర్నల్ ఆఫ్ మైక్రోబియల్ & బయోకెమికల్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

ఎ రిటర్న్ టు మైక్రోబియల్ జీనోమ్స్ ఇన్ ది మెటాజినోమ్ ఏజ్

ఎరిక్ ఆల్టర్‌మాన్

సూక్ష్మజీవుల పర్యావరణ వ్యవస్థలు, ఫైలోజెనెటిక్ వైవిధ్యం మరియు జన్యు సంక్లిష్టతలో మెటాజెనోమిక్స్ గణనీయంగా విస్తరించింది. కొన్ని సంవత్సరాల వ్యవధిలో మైక్రోబియల్ జెనోమిక్స్ 1.8 మెగాబేస్ పెయిర్ (Mbp) జీనోమ్ నుండి (1995లో హేమోఫిలస్ ఇన్ఫ్లుఎంజా Rd 1995లో Rd) (1995లో హేమోఫిలస్ ఇన్‌ఫ్లుఎంజా Rd) (మెటా) జెనోమ్ ప్రోగ్రామ్‌లకు ఒక నాటకీయ పెరుగుదలను చూసింది. సీక్వెన్స్ డేటా ప్రతి ఒక్కటి టెరాబేస్ జత కంటే ఎక్కువ. ఈ పురోగతులు మరింత శక్తివంతమైన సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీల ద్వారా సాధ్యమయ్యాయి. ఫ్లోరోసెంట్ స్లాబ్-జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్ పద్ధతులు కేశనాళిక-ఆధారిత వ్యవస్థలచే భర్తీ చేయబడ్డాయి, ఇది నిర్గమాంశ మరియు ఆటోమేషన్ స్థాయిని గణనీయంగా పెంచింది. "సీక్వెన్సింగ్ బై సింథసిస్" పరిచయంతో ఒక దశ మార్పు వచ్చింది. ఈ సాంకేతికత 'పైరోక్సెన్సింగ్'గా వాణిజ్యీకరించబడింది, ముఖ్యంగా 454 లైఫ్ సైన్సెస్ ద్వారా. ప్రారంభంలో 100-200 న్యూక్లియోటైడ్‌ల (nt) యొక్క తక్కువ రీడ్ లెంగ్త్‌లను మాత్రమే అందించింది మరియు తక్కువ బేస్ కాల్ నాణ్యత మరియు న్యూక్లియోటైడ్‌ల హోమోపాలిమెరిక్ స్ట్రెచ్‌లతో సమస్యలను కలిగి ఉంది, ఇది క్యాపిలరీ సాంగర్ నుండి సీక్వెన్సింగ్ కెపాసిటీలో (పరుగుకు 400 Mbp వరకు) లీప్‌ను అందించింది. -ఆధారిత సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీస్. అప్పటి నుండి అనేక ఇతర తదుపరి తరం సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లు వాణిజ్యీకరించబడ్డాయి (ఇల్యూమినా, SOLID, అయాన్ టోరెంట్ వంటివి), ప్రతి ఒక్కటి ఒక్కో పరుగుకు పొందిన సీక్వెన్స్ సమాచారాన్ని పెంచుతుంది (ఇల్యూమినా HiSeq2500 ప్రస్తుతం ప్రతి పరుగుకు 600 Gbp వరకు అందిస్తుంది). సింగిల్ మాలిక్యూల్ రియల్ టైమ్ (SMRT) సీక్వెన్సింగ్ ఇంకా ప్రారంభ దశలోనే ఉన్నప్పటికీ, ఇది "తదుపరి పెద్ద విషయం" కావచ్చు మరియు ప్రోటోటైప్‌లు (ప్రధానంగా పసిఫిక్ బయోసైన్సెస్ నుండి) ప్రస్తుతం ట్రయల్ చేయబడుతున్నాయి.