బాక్టీరియాలజీ & పారాసిటాలజీ జర్నల్

నైరూప్య

జెనస్ మైకోబాక్టీరియం పాపులేషన్ స్ట్రక్చర్ కోసం కొత్త ఉదాహరణ

పాల్ జెఫ్రీ ఫ్రైడ్లిన్

మైకోబాక్టీరియం జాతికి చెందిన వ్యాధికారక జాతులు క్షయ మరియు లెప్రే ఉన్నాయి, అదనంగా కనీసం 148 కొన్నిసార్లు అవకాశవాద వ్యాధికారక జాతులు పర్యావరణ సముదాయాలను ఆక్రమిస్తాయి. మైకోబాక్టీరియం జాతి ఆక్టినోమైసెట్స్‌తో పాటు ఇతర యాసిడ్-ఫాస్ట్ జెనెరాలతో పాటు వాటి కణ గోడలలోని మైకోలిక్ యాసిడ్‌లు, కోరిన్‌బాక్టీరియం, నోకార్డియా మరియు రోడోకోకస్ వంటి వాటిలో ఉన్నాయి. DNA-ఆధారిత RNA పాలిమరేస్ సబ్యూనిట్ b జన్యువు rpoB, ఈ బ్యాక్టీరియాలో సాపేక్షంగా సంరక్షించబడింది. rpoB యొక్క 342bp ఫ్రాగ్‌మెంట్‌లోని సీక్వెన్స్ పాలిమార్ఫిజం చాలా రకాల మైకోబాక్టీరియం మధ్య తేడాను గుర్తించడానికి సరిపోతుంది. ఏది ఏమైనప్పటికీ, ఈ పాలీమార్ఫిజం లేదా ఇతర జెనోమిక్ ప్రాంతాలలో పాలిమార్ఫిజం ఆధారంగా ఒక బలమైన మరియు పరీక్షించదగిన ఫైలోజెని లేదా జనాభా నిర్మాణం యొక్క నిర్మాణం అస్పష్టంగానే ఉంది. ఈ అధ్యయనం మైకోబాక్టీరియం జనాభా నిర్మాణం యొక్క ప్రజాతి పరిష్కారానికి కొత్త నమూనాను అందిస్తుంది. 47 మైకోబాక్టీరియం జాతులకు జెన్‌బ్యాంక్ డేటా నుండి పొందిన 342bp rpoB ఫ్రాగ్‌మెంట్‌పై 5 ఎంజైమ్‌ల కోసం సిలికోలో కనుగొనబడిన పరిమితి ఎంజైమ్ సైట్ పాలిమార్ఫిజమ్‌లపై కనిష్టంగా విస్తరించే చెట్టు (MST) నిర్మించబడింది మరియు కొరినేబాక్టీరియం, నోకార్డియా మరియు రోడోకోకస్ నుండి ఒక్కొక్క జాతి. MST అనుభావికంగా 3 ప్రాంతాలుగా విభజించబడింది. నెమ్మదిగా పెరుగుతున్న మైకోబాక్టీరియా (SGM) యొక్క హాలోతో వేగంగా అభివృద్ధి చెందుతున్న అన్ని మైకోబాక్టీరియా (RGM) MST-ప్రాంతం 1లో కనుగొనబడింది. మైకోబాక్టీరియం జనాభా నిర్మాణం యొక్క MST-ప్రాంతాల నమూనా యొక్క ఖచ్చితత్వం నిర్దిష్ట నిర్దిష్ట అనుసంధాన అసమతుల్యత ద్వారా ధృవీకరించబడింది. పరిమితి సైట్ యుగ్మ వికల్పాలు. నిర్దిష్ట యుగ్మ వికల్పాల కోసం, MST-ప్రాంతం 1లోని SGM MST-ప్రాంతం 1 యొక్క RGMని MST-ప్రాంతం 1 యొక్క SGMని పోలి ఉంటుంది. తులనాత్మక జన్యుశాస్త్రం మరియు రైబోసోమల్ RNA (రిబోసోమల్ RNA) నుండి అంచనాలతో సహా ప్రచురించబడిన జెనోటైపిక్ మరియు ఫినోటైపిక్ పరిశీలనలకు అనుగుణంగా మోడల్ ఫ్రేమ్‌వర్క్‌ను అందించింది. rRNA) జాతుల మధ్య జన్యు లక్షణాల పంపిణీ మరియు జాతుల క్లాడిస్టిక్ సమూహాలను నివేదించింది. Corynebacterium diphtheriae, Nocardia nova మరియు Rhodococcus equi వరుసగా MSTregions 2, 3, మరియు 1కి చెందినవి. ముగింపులో, మైకోబాక్టీరియం జనాభా నిర్మాణం యొక్క MST-ప్రాంతాల నమూనా దృఢమైనది, నిస్సందేహంగా, యుగ్మ వికల్పాలకు పారదర్శకంగా, జన్యురూపాలు మరియు సమలక్షణాలకు అనుగుణంగా మరియు గణాంకపరంగా పరీక్షించదగినది.