జర్నల్ ఆఫ్ ఫార్మకోజెనోమిక్స్ & ఫార్మాకోప్రొటోమిక్స్

నైరూప్య

ఫార్మకోజెనోమిక్స్ అధ్యయనాలకు అధిక-నిర్గమాంశ నిజ-సమయ PCR విధానం

టాయినెట్ హార్ట్‌షోర్న్, ఫెర్రియర్ లే, జోర్డాన్ లాంగ్, హారిసన్ లియోంగ్, కాథ్లీన్ హయాషిబారా, డొమినిక్ డెవోల్ఫ్ మరియు ఇలియట్ షెల్టాన్

వ్యక్తిగతీకరించిన ఔషధంలోని పురోగతి ఔషధ జీవక్రియ ఎంజైమ్ మరియు ట్రాన్స్పోర్టర్ జన్యు పాలిమార్ఫిజమ్‌ల కోసం వ్యక్తులను పరీక్షించే ఫార్మాకోజెనోమిక్స్ అధ్యయనాల పెరుగుదలకు దారితీసింది. పర్యవసానంగా, శీఘ్ర నమూనా నుండి ఫలితాల వర్క్‌ఫ్లోలతో సరసమైన, ఉపయోగించడానికి సులభమైన సాంకేతికతలకు డిమాండ్ పెరుగుతోంది, ఇది లక్ష్య జన్యు వైవిధ్యాల అనుకూలీకరించదగిన సెట్‌లను మరియు మార్చగల నమూనాల సంఖ్యను పరీక్షించడానికి వీలు కల్పిస్తుంది. అదనంగా, ఒక వ్యక్తి యొక్క జన్యు సమాచారాన్ని వారి జన్యు-స్థాయి స్టార్ అల్లెల్ హాప్లోటైప్‌ల డిప్లాయిడ్ కంటెంట్‌కు అనువదించడానికి డేటా విశ్లేషణ సాధనాలు అవసరం, ఇది ఔషధ జీవక్రియ ఎంజైమ్ ఫినోటైప్‌లతో పరస్పర సంబంధం కలిగి ఉంటుంది. ఈ అవసరాన్ని తీర్చడానికి సమగ్ర ఫార్మాకోజెనోమిక్స్ ప్రయోగాల వర్క్‌ఫ్లో సొల్యూషన్ అభివృద్ధిని మేము ఇక్కడ వివరించాము. QuantStudio™ 12K ఫ్లెక్స్ సిస్టమ్‌లో వరుసగా OpenArray® మరియు 384-వెల్ ప్లేట్ ఫార్మాట్‌లలో TaqMan® SNP జన్యురూపం మరియు కాపీ నంబర్ పరీక్షలతో నడిచే శుద్ధి చేయబడిన బుక్కల్ స్వాబ్ DNAల నుండి అధిక నాణ్యత డేటా రూపొందించబడింది. డేటా విశ్లేషణ SNP జన్యురూప పరీక్ష ఫలితాలను పరిశీలించడానికి TaqMan® Genotyper™ సాఫ్ట్‌వేర్‌ను మరియు కాపీ నంబర్ పరీక్ష ఫలితాలను పరిశీలించడానికి CopyCaller® సాఫ్ట్‌వేర్‌ని ఉపయోగించి, ఇటీవల అభివృద్ధి చేసిన AlleleTyper™ని ఉపయోగించి అల్లెల్ జన్యురూపాలను నక్షత్రం చేయడానికి వ్యక్తిగత నమూనాల కోసం ఈ జన్యు డేటాను అనువదించడం ద్వారా డేటా విశ్లేషణ సాధించబడింది. నిర్దిష్ట TaqMan® SNP జెనోటైపింగ్ మరియు ఉపయోగించిన జన్యు వైవిధ్యాలకు కాపీ సంఖ్య పరీక్షలు ఇచ్చిన ఫార్మాకోజెనోమిక్స్ అధ్యయనం యొక్క అవసరాలకు అనుగుణంగా రూపొందించబడతాయి. ఈ తక్కువ ధర, అధిక నిర్గమాంశ ఫార్మాకోజెనోమిక్స్ వర్క్‌ఫ్లో నమూనా తయారీ నుండి డేటా విశ్లేషణ వరకు ఒకే రోజులో పూర్తి చేయవచ్చు.