జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ ద్వారా క్లేబ్సియెల్లా వరికోలా మరియు K. ఆక్సిటోకా యొక్క నిర్దిష్ట గుర్తింపు

జారెడ్ యసుహరా-బెల్, కాలేబ్ అయిన్, ఏప్రిల్ హటాడా, యోంగ్‌హూన్ యూ, రాబర్ట్ ఎల్. ష్లబ్ మరియు అన్నే ఎం. అల్వారెజ్

క్లేబ్సియెల్లా spp. క్లినికల్, వెటర్నరీ మరియు ప్లాంట్-అసోసియేటెడ్ ఐసోలేట్‌లతో అవకాశవాద వ్యాధికారకాలు . గ్వామ్‌లో తీవ్రంగా క్షీణించిన ఐరన్‌వుడ్ చెట్ల వెట్‌వుడ్ నుండి బాక్టీరియా స్రవించడంలో రాల్‌స్టోనియా సోలనాసియరం , క్లేబ్సియెల్లా వరికోలా మరియు కె. ఆక్సిటోకా ఉన్నాయని మునుపటి అధ్యయనం చూపించింది . ఈ అధ్యయనంలో, లూప్-మెడియేటెడ్ ఐసోథర్మల్ యాంప్లిఫికేషన్ (LAMP) ప్రత్యేకంగా K. వరికోలా మరియు K. ఆక్సిటోకాను గుర్తించింది, ప్రతి జీవికి వ్యక్తిగతంగా రూపొందించిన ప్రత్యేక ప్రైమర్ సెట్‌లను ఉపయోగిస్తుంది. ప్రతి LAMP దాని లక్ష్యాన్ని ప్రత్యేకంగా గుర్తించింది, లక్ష్యం కాని బ్యాక్టీరియా మరియు ప్రతికూల నియంత్రణల కోసం ప్రతికూల ఫలితాలను చూపుతుంది. LAMP క్లెబ్సియెల్లాను టీకాలు వేయబడిన-ఇనుము చెక్క కాండం కణజాలం మరియు బాక్టీరియల్ ఊజ్‌లో గుర్తించింది. ప్లాంట్ ఇన్హిబిటర్స్ ఉన్నందున, వివిధ నమూనా ప్రోటోకాల్‌లు పరీక్షించబడ్డాయి. బాక్టీరియాను ద్రావణంలోకి వ్యాప్తి చేయడానికి మొక్కల కణజాల నమూనాలను నానబెట్టడం, ఉడకబెట్టడం, మొక్కల నమూనాల నుండి నేరుగా క్లేబ్సిల్లా యొక్క సరైన గుర్తింపును అందించింది. చూర్ణం చేసిన మొక్కల నమూనాలను ఉపయోగించినప్పుడు పొందిన తప్పుడు ప్రతికూలతలు, పూత మరియు 12-h పొదిగే ప్రక్రియతో కూడిన సుసంపన్నత దశను చేర్చడం ద్వారా తొలగించబడతాయి. DGGE (గ్రేడియంట్ జెల్ ఎలెక్ట్రోఫోరేసిస్‌ను తొలగించడం) మరియు క్లెబ్సియెల్లా-నిర్దిష్ట యాంటీబాడీని ఉపయోగించి కాలనీ-బ్లాట్ ఇమ్యునోఅస్సే కూడా క్లెబ్సిల్లాను టీకాలు వేసిన ఐరన్‌వుడ్‌లో గుర్తించాయి. DGGE బ్యాండ్‌లు మరియు దగ్గరి సంబంధం ఉన్న ఎంటర్‌బాక్టర్‌ల నుండి యాంటీబాడీ క్రాస్‌రియాక్షన్‌లు తప్పుడు సానుకూల ఫలితాల సంభావ్యతను చూపించాయి. LAMP యొక్క స్వభావం పాయింట్-ఆఫ్-కేర్ టెస్టింగ్‌కు అనువైనదిగా చేస్తుంది మరియు ఈ అధ్యయనంలో అభివృద్ధి చేసిన LAMP ప్రైమర్‌ల ప్రత్యేకతతో కలిపినప్పుడు, గ్వామ్‌లోని ఐరన్‌వుడ్‌లో క్లేబ్సియెల్లా కోసం ఒక సాధారణ క్షేత్ర పరీక్షగా దాని సామర్థ్యాన్ని ప్రదర్శిస్తుంది, అలాగే క్లినికల్ మరియు క్లెబ్సియెల్లా ఇన్ఫెక్షన్ యొక్క పశువైద్య నిర్ధారణ. అదనంగా, ఈ అధ్యయనంలో గుర్తించడం కోసం లక్ష్యంగా పెట్టుకున్న ప్రాంతాలు అన్ని రకాల పరమాణు-ఆధారిత విశ్లేషణలలో అనువర్తనాన్ని కలిగి ఉంటాయి.