జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

నిజ-సమయ PCRని ఉపయోగించి మట్టి మరియు మొక్కల నమూనాలలో ఫ్యూసేరియం ఉడమ్‌ను వేగంగా గుర్తించడం మరియు లెక్కించడం

సుకుమార్ మేసపోగు, బండమరావూరి కిషోర్ బాబు, అచల బక్షి, సోమసాని ఎస్. రెడ్డి, సంగీత సక్సేనా, అలోక్ కె. శ్రీవాస్తవ మరియు దిలీప్ కె. అరోరా

Fusarium udum కోసం నిజ-సమయ PCR ఆధారిత గుర్తింపు పరీక్ష అభివృద్ధి చేయబడింది, దీని వలన పావురం యొక్క వాస్కులర్ విల్ట్ ఏర్పడుతుంది. F. udum యొక్క హిస్టోన్-3 జన్యువు జాతుల-నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌లను మరియు ప్రోబ్‌లను రూపొందించడానికి లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది. విభిన్న నమూనాల నుండి F. ఉడమ్‌ను గుర్తించడం మరియు పరిమాణీకరించడం కోసం విశ్వసనీయమైన మరియు పునరుత్పాదక విధానాన్ని అభివృద్ధి చేయడానికి తులనాత్మక అధ్యయనం చేపట్టబడింది. ఒలిగోన్యూక్లియోటైడ్‌ల యొక్క సున్నితత్వం మరియు విశిష్టత డాట్ బ్లాట్ హైబ్రిడైజేషన్, స్టాండర్డ్ మరియు రియల్-టైమ్ PCR అస్సేస్ ద్వారా మూల్యాంకనం చేయబడ్డాయి. ప్రోబ్ HFUSP ఎఫ్. ఉడమ్ యొక్క స్వచ్ఛమైన సంస్కృతుల నుండి పర్యావరణ DNA నమూనాల నుండి పొందిన DNA కోసం అధిక స్థాయి సున్నితత్వాన్ని చూపించింది. qPCR పరీక్ష F. ఉడమ్‌ను ఫ్యూసేరియం, ఇతర పరీక్ష సూక్ష్మజీవులు మరియు పర్యావరణ నమూనాల దగ్గరి సంబంధం ఉన్న జాతుల నుండి ప్రత్యేకంగా వేరు చేసింది. 84.17 వద్ద సింగిల్ మెల్టింగ్ కర్వ్ మరియు 200 bp యొక్క మోనోమార్ఫిక్ బ్యాండ్ PCR పరీక్షల యొక్క నిర్దిష్టత మరియు ప్రామాణికతను సూచిస్తుంది. అందువల్ల, నిజ-సమయ PCR పరీక్ష సంక్లిష్ట వాతావరణాల నుండి F. ఉడమ్ యొక్క నిమిషాల మొత్తాలను గుర్తించగల వేగవంతమైన మరియు సమర్థవంతమైన ప్రక్రియగా ఉపయోగించబడుతుంది. అందువల్ల, ప్రస్తుత అధ్యయనంలో ప్రదర్శించబడిన నిజ-సమయ PCR పరీక్షను పావురం యొక్క వాస్కులర్ విల్ట్ యొక్క ప్రారంభ సంక్రమణ మరియు వ్యాధి ఎపిడెమియాలజీ కోసం F. ఉడమ్‌ను గుర్తించడం మరియు పర్యవేక్షించడం కోసం విజయవంతంగా ఉపయోగించవచ్చు.