జర్నల్ ఆఫ్ ఫార్మకోజెనోమిక్స్ & ఫార్మాకోప్రొటోమిక్స్

నైరూప్య

సెకండరీ స్ట్రక్చర్ ప్రిడిక్షన్ ప్రోగ్రామ్‌లను ఉపయోగించి డైహైడ్రోపిరిమిడిన్ డీహైడ్రోజినేస్ జీన్ (DPYD) పాలిమార్ఫిజంతో అనుబంధించబడిన 5-ఫ్లోరోరాసిల్ టాక్సిసిటీ యొక్క అంచనా

క్యోంగీ కుమారుడు

5-ఫ్లోరోరాసిల్ (5-FU) డైహైడ్రోపిరిమిడిన్ డీహైడ్రోజినేస్ (DPD) ద్వారా వేగంగా అధోకరణం చెందుతుంది, ఇది 5-FU మరియు పిరిమిడిన్‌ల ఉత్ప్రేరక మార్గంలో మొదటి మరియు రేటు-పరిమితం చేసే ఎంజైమ్. DPD-సాధారణ రోగికి 5-FU యొక్క సహించదగిన చికిత్సా మోతాదు DPD-లోపం ఉన్న రోగిని భరించలేనిదిగా చేస్తుంది. శరీరం యొక్క ప్రతిస్పందన మరియు ఔషధాలకు సహనంలో ఈ అంతర్-వ్యక్తిగత వ్యత్యాసాలు డైహైడ్రోపిరిమిడిన్ డీహైడ్రోజినేస్ జన్యువు (DPYD) సింగిల్ న్యూక్లియోటైడ్ పాలిమార్ఫిజమ్స్ (SNPలు) కారణంగా చెప్పవచ్చు. రోగి యొక్క జీవితాన్ని మరియు డబ్బును ఆదా చేయడానికి, క్లినికల్ ట్రయల్స్ లేదా 5-FU థెరపీకి ముందు 5-FUకి రోగి యొక్క సహనాన్ని తెలుసుకోవడానికి ఆరోగ్య నిపుణులకు అనుకూలమైన మరియు నమ్మదగిన మార్గం అవసరం. ఎవరికైనా ఉచితంగా లభించే సెకండరీ స్ట్రక్చర్ ప్రిడిక్షన్ ప్రోగ్రామ్‌లు, YASPIN, PSIPRED మరియు Jpred 3ని ఉపయోగించి 5-FUకి వ్యక్తి యొక్క అసహనాన్ని అంచనా వేయడానికి ఇక్కడ నేను సరళమైన, సులభమైన మరియు వేగవంతమైన మార్గాన్ని అందిస్తున్నాను. ఈ ప్రోగ్రామ్‌లు DPYD లోపల మ్యుటేషన్ (లు)తో మరియు లేకుండా DPD ద్వితీయ నిర్మాణాన్ని అంచనా వేస్తాయి, తద్వారా మానవ DPD డొమైన్‌ల ఫంక్షనల్ సైట్‌లపై మ్యుటేషన్-ప్రేరిత నిర్మాణ మార్పుల ప్రభావాన్ని తగ్గించవచ్చు. నమూనాలుగా విశ్లేషించబడిన 11 SNPలలో, DPD డొమైన్ Vలోని రెండు మిస్సెన్స్ ఉత్పరివర్తనలు, D949V (SNP A2846T) మరియు C953S (SNP G2858C), [4Fe-4S] క్లస్టర్‌లకు బాధ్యత వహించే డొమైన్ కోర్‌కు అంతరాయం కలిగిస్తుందని అంచనా వేయబడింది. ఇంకా, DPYDలోని ఒక స్ప్లికింగ్ ప్రాంతంలో (14 G1Aలో) ఒక పాయింట్ మ్యుటేషన్ కత్తిరించబడిన DPD mRNAలు (ఎక్సాన్ 14 స్కిప్పింగ్) మరియు డిసేబుల్డ్ DPD ప్రోటీన్‌లను (D581 నుండి N635 వరకు 55 అమైనో ఆమ్లాలు లేవు) ఉత్పత్తి చేస్తుందని అంచనా వేయబడింది, ఇది DPD కార్యాచరణను పూర్తిగా కోల్పోతుంది. . ఎక్సాన్ 14 స్కిప్పింగ్, D949V మరియు C953S మ్యుటేషన్ సమక్షంలో మానవ DPD యొక్క త్రిమితీయ నిర్మాణాలలో గణనీయమైన మార్పును SWISS-MODEL అంచనా వేస్తుంది. ఈ విధంగా, ఈ ద్వితీయ నిర్మాణ అంచనా ప్రోగ్రామ్‌ల ద్వారా అంచనా వేయడం DPYDలోని మ్యుటేషన్ (లు) కారణంగా 5-FUకి సంబంధించిన విషపూరితం గురించి ఉపయోగకరమైన మరియు నమ్మదగిన సమాచారాన్ని అందిస్తుంది.