బయోకెమిస్ట్రీ & అనలిటికల్ బయోకెమిస్ట్రీ

నైరూప్య

Human.miRFFL.DB: హ్యూమన్ miRNA కోరెగ్యులేటరీ నెట్‌వర్క్‌లు మరియు అసోసియేటెడ్ రెగ్యులేటరీ-సర్క్యూట్‌ల కోసం క్యూరేటెడ్ రిసోర్స్

పంకజ్ ఖురానా*, రాజీవ్ వర్ష్నే, ఆర్ సుగదేవ్

జన్యు నియంత్రణ అనేది ఒక సంక్లిష్ట ప్రక్రియగా పరిగణించబడుతుంది, ఇక్కడ నియంత్రణ అంశాలు మరియు వాటి లక్ష్యాలు అత్యంత సంక్లిష్టమైన నెట్‌వర్క్ పరస్పర చర్యలను ఏర్పరుస్తాయి, తద్వారా సాధారణ జీవ శరీరధర్మ శాస్త్రం మరియు వ్యాధి-ప్రారంభం మరియు పురోగతిని కూడా ప్రభావితం చేస్తుంది. ట్రాన్స్క్రిప్షన్ కారకాలు (TF) మరియు మైక్రోఆర్ఎన్ఎ (మిఆర్ఎన్ఎ) ముఖ్యమైన జీవ ప్రక్రియలను నియంత్రించే జన్యు వ్యక్తీకరణ యొక్క ప్రాథమిక ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ మరియు పోస్ట్-ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ రెగ్యులేటర్లు. ఇటీవలి సంవత్సరాలలో, అనేక అధిక నిర్గమాంశ అధ్యయనాలు సంక్లిష్ట నియంత్రణ పరస్పర చర్యలు miRNA మరియు TF మధ్య సంక్లిష్ట పరస్పర చర్య ద్వారా ఒక టార్గెట్ జీన్ (TG)ని నియంత్రిస్తాయి. miRNAలు మరియు TFలు కూడా ఒకదానికొకటి నియంత్రిస్తాయి. ఈ సంక్లిష్టమైన నియంత్రణ యంత్రాంగాన్ని miRNA:TF:TG కోర్గ్యులేటరీ నెట్‌వర్క్ రూపంలో సూచించవచ్చు. రెగ్యులేటరీ-సర్క్యూట్‌లుగా పిలువబడే అనేక చిన్న పునరావృత సబ్‌గ్రాఫ్‌లను గుర్తించడానికి ఈ నెట్‌వర్క్ ఉపయోగించబడుతుంది. ఫీడ్-ఫార్వర్డ్ లూప్స్ (FFLs) అని కూడా పిలువబడే ఈ రెగ్యులేటరీ-సర్క్యూట్‌లలో ఒకటి మూడు-నోడ్ నమూనా, ఇది miRNA మరియు TFతో కూడి ఉంటుంది, వీటిలో ఒకటి మరొకదానిని నియంత్రిస్తుంది మరియు రెండూ సంయుక్తంగా TGని నియంత్రిస్తాయి. ఈ రెగ్యులేటరీ-సర్క్యూట్‌లు అనేక శారీరక మరియు రోగలక్షణ పరిస్థితులలో జన్యు నియంత్రణ యొక్క సంక్లిష్ట పరస్పర చర్యను వివరించడంలో ఉపయోగకరంగా నిరూపించబడ్డాయి.

Human.miRFFL.DB అనేది మానవ miRNA:TF:TG కోరెగ్యులేటరీ డైరెక్ట్ నెట్‌వర్క్‌లు మరియు వాటి అనుబంధిత నియంత్రణ-సర్క్యూట్‌ల కోసం సమగ్ర సమగ్ర వనరు. గ్రాఫ్ థియరీ సూత్రం ఆధారంగా అంతర్గత స్క్రిప్ట్‌లు రెండు రకాల FFL మూలాంశాలను అంటే miRNA-FFL మరియు TF-FFLలను గుర్తించడానికి ఉపయోగించబడ్డాయి. డేటాబేస్ అదనంగా కోర్గ్యులేటరీ నెట్‌వర్క్‌లు మరియు అనుబంధిత FFLల ఇంటరాక్టివ్ విజువలైజేషన్‌ను అందిస్తుంది. Human.miRFFL.DBని హ్యూమన్ miRNA:TF:TG కోరెగ్యులేటరీ నెట్‌వర్క్‌లు మరియు ఈ రెగ్యులేటరీ బయోమాలిక్యూల్స్ యొక్క సంక్లిష్ట సెల్యులార్ ఇంటరాక్షన్‌లను డీక్రిప్ట్ చేయడం కోసం అనుబంధిత FFLల కోసం సమగ్ర సిద్ధంగా సూచనగా ఉపయోగించవచ్చు. Human.miRFFL.DB ఆన్‌లైన్‌లో http:// mirffldb.in/human/లో అందుబాటులో ఉంది