నస్టస్జా వాస్సిలేవ్, డోరిస్ హిల్లెమాన్, ఫ్లోరియన్ P. మౌరర్, థామస్ A. కోల్, మథియాస్ మెర్కర్, ఫోల్కే బ్రింక్మన్, మార్క్ లిప్మన్ మరియు కాథరినా క్రాంజర్
పరిచయం: ఒక కొత్త లైన్ ప్రోబ్ అస్సే, GenoType® NTM DR, ఉపజాతి గుర్తింపు మరియు క్లినికల్ మైకోబాక్టీరియం అబ్సెసస్ ఐసోలేట్లలో మాక్రోలైడ్లు మరియు అమినోగ్లైకోసైడ్లకు నిరోధకతను గుర్తించడం కోసం అభివృద్ధి చేయబడింది. DNA సీక్వెన్సింగ్ మరియు ఫినోటైపిక్ డ్రగ్ ససెప్టబిలిటీ టెస్టింగ్ (pDST)తో పోలిస్తే మేము పరీక్ష పనితీరును అధ్యయనం చేసాము.
పద్ధతులు: 2015 మరియు 2016 మధ్య సేకరించిన 48 క్లినికల్ M. అబ్సెసస్ ఐసోలేట్లు ఉపజాతుల స్థాయికి గుర్తించబడ్డాయి మరియు సాంగర్ సీక్వెన్సింగ్ ద్వారా erm (41) జన్యురూపం, rrl మరియు rrs జన్యు ఉత్పరివర్తనాల కోసం విశ్లేషించబడ్డాయి. క్లారిథ్రోమైసిన్ మరియు అమికాసిన్ యొక్క pDST కోసం ఉడకబెట్టిన పులుసు మైక్రో డైల్యూషన్ జరిగింది. ఫలితాలు GenoType® NTM DR పరీక్షతో పోల్చబడ్డాయి. పునరావృత pDST మరియు మొత్తం జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్ (WGS) ద్వారా అసమ్మతి ఫలితాలు మరింత విశ్లేషించబడ్డాయి.
ఫలితాలు: 35 ఐసోలేట్లు M. అబ్సెసస్ సబ్స్పిగా గుర్తించబడ్డాయి. abscessus , 6 M. అబ్సెసస్ subsp. bolletii , మరియు 7 గా M. అబ్సెసస్ సబ్స్పి. rpoB సీక్వెన్స్ల ఆధారంగా మాసిలియెన్స్. సాంగర్ సీక్వెన్సింగ్తో జెనోటైప్ ® NTM DR ఫలితాల సమన్వయం ఉపజాతుల గుర్తింపు కోసం 92% మరియు వరుసగా erm (41), rrl మరియు rrs జన్యురూపాలకు 100%. GenoType® NTM DR మరియు pDST ఫలితాలు క్లారిథ్రోమైసిన్ నిరోధకత కోసం 98% మరియు పునరావృత pDST ఫలితాలు పరిగణనలోకి తీసుకున్నప్పుడు అమికాసిన్ నిరోధకత కోసం 96% సరిపోలాయి.
తీర్మానం: కొత్త GenoType® NTM DR పరీక్ష అనేది M. అబ్సెసస్ ఐసోలేట్ల ఉపజాతి గుర్తింపు మరియు అమికాసిన్ మరియు క్లారిథ్రోమైసిన్లకు నిరోధకతను అందించే నిర్వచించిన ఉత్పరివర్తనాలను గుర్తించడం కోసం ఒక విలువైన పరీక్ష. లైన్ ప్రోబ్ అస్సే మరియు pDST మధ్య వ్యత్యాసాలు ప్రధానంగా ఫినోటైపిక్ పరీక్ష ఫలితాలలో వైవిధ్యాలకు సంబంధించినవి.