ఆగ్రోటెక్నాలజీ

నైరూప్య

సింపుల్ సీక్వెన్స్ రిపీట్స్ (SSR) మార్కర్లను ఉపయోగించి ఏరియల్ యమ్ ( డియోస్కోరియా బల్బిఫెరా L)లో జన్యు వైవిధ్యం యొక్క మూల్యాంకనం

Aniefiok Ndubuisi Osuagwu, Edem UL

డయోస్కోరియా బల్బిఫెరా అనేది పశ్చిమ ఆఫ్రికాలోని ఉష్ణమండల మరియు ఉప సహారా ప్రాంతాలలో విస్తృతంగా పంపిణీ చేయబడిన డయోస్కోరియాసియా కుటుంబానికి చెందిన తక్కువ ఉపయోగించని పంట. ఇంటర్నేషనల్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ ట్రాపికల్ అగ్రికల్చర్ (IITA) జెర్మ్ ప్లాస్మ్ బ్యాంక్‌లో జరిగిన పశ్చిమ ఆఫ్రికా నుండి ఇరవై ఐదు D. బల్బిఫెరా ప్రవేశాలు 96 బాగా మైక్రో టైట్రే ప్లేట్ PCR ప్రతిచర్యలలో 25 ul వాల్యూమ్ రియాక్షన్‌లో పది మైక్రోసాటిలైట్ లొకిని ఉపయోగించి జన్యు వైవిధ్యం కోసం పరీక్షించబడ్డాయి. ప్రతిచర్య మిశ్రమంలో 3 µ l 10 ng/ µ l టెంప్లేట్ DNA, 2 µ l 2.5 mM DNTPలు, 1 µ l 2.5 mM MgCl ₂ , 1 µ ఫార్వర్డ్ మరియు రివర్స్ ప్రైమర్‌లు, 1 µ l DMSO ₄ , 0.1 µ l యొక్క 5 µ g/ µ l Taq DNA పాలిమరేస్ (ఇన్విట్రోజెన్) మరియు 3 µ l యొక్క 10 ng/ µ l DNA. 13.4 µ l న్యూక్లీస్ ఫ్రీ వాటర్‌ని ఉపయోగించి మొత్తం ప్రతిచర్య వాల్యూమ్ 25 వాల్యూమ్ వరకు చేయబడింది . PCR ప్రోగ్రామ్ 30 సెకన్లకు 94°C వద్ద డీనాటరేషన్‌ను కలిగి ఉంటుంది, తర్వాత 30 సెకన్లకు 94 °C, 20 సెకన్లకు 55 లేదా 45 °C మరియు 30 సెకన్లకు 72 °C, చివరి పొడిగింపు దశ 72 °C వద్ద ఉంటుంది. 7నిమి. లోకస్‌కు సగటు యుగ్మ వికల్ప సంఖ్య 7.4తో మొత్తం 74 యుగ్మ వికల్పాలు కనుగొనబడ్డాయి. ఒక పాలిమార్ఫిక్ ఇన్ఫర్మేషన్ కంటెంట్ (PIC) సగటు విలువ 0.74 ప్రవేశాలలో వైవిధ్యం ఉనికిని చూపింది. సగటు జన్యు వైవిధ్యం విలువ 0.77 కూడా గమనించబడింది. D. బల్బిఫెరా ప్రవేశాల మధ్య జన్యు వైవిధ్యం మరియు సంబంధాలను నిర్ణయించడంలో SSR విధానం విలువైన సాధనంగా నిరూపించబడింది . ఈ పంట పరిరక్షణ మరియు జన్యు మెరుగుదల కార్యక్రమంలో ఈ ఫలితాలు ముఖ్యమైనవి.