హజీఘ్రారి బి, ఫరోఖి ఎన్, గోలియాయి బి మరియు కవౌసి కె
మైక్రోఆర్ఎన్ఏలు (మిఆర్ఎన్ఏలు) అనేది దాదాపు 22 న్యూక్లియోటైడ్ల యొక్క సింగిల్ స్ట్రాండెడ్ నాన్-కోడింగ్ ఎండోజెనస్ చిన్న RNAలు, ఇవి పోస్ట్ ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ స్థాయిలో జన్యు వ్యక్తీకరణను నియంత్రించడంలో ప్రత్యక్షంగా పాల్గొంటాయి. బయోటిక్ మరియు అబియోటిక్ ఒత్తిళ్లకు అభివృద్ధి మరియు ప్రతిస్పందనలో miRNAలు కీలక పాత్ర పోషిస్తాయి. హోమోలజీ శోధనలు కొత్త miRNAలను వృక్ష జాతులలో వాటి సాపేక్ష అధిక పరిరక్షణ కారణంగా గుర్తించడానికి అనుమతిస్తాయి. ఇక్కడ, అంబోరెల్లా ట్రైకోపోడా కోసం miRNA లు గుర్తించబడ్డాయి. miRBase నుండి తెలిసిన మరియు ప్రత్యేకమైన ప్లాంట్ miRNAలు A. ట్రైకోపోడాలో ఎక్స్ప్రెస్డ్ సీక్వెన్స్ ట్యాగ్ (EST) మరియు జెనోమిక్ సర్వే సీక్వెన్స్ (GSS)కి వ్యతిరేకంగా BLAST-శోధించబడ్డాయి. తగిన ఫోల్డ్ బ్యాక్ స్ట్రక్చర్తో ఉన్న అన్ని క్యాండిడేట్ సీక్వెన్సులు miRNA ఫిల్టరింగ్ ప్రమాణాల శ్రేణి ద్వారా ప్రదర్శించబడ్డాయి. చివరగా, మేము ESTల నుండి 5 miRNA జన్యు కుటుంబాలకు చెందిన 5 సంభావ్య సంరక్షించబడిన miRNAల పరిరక్షణను గుర్తించాము మరియు విశ్లేషించాము అలాగే GSSల నుండి 39 miRNA కుటుంబాలపై ఆధారపడిన 82 కొత్తగా గుర్తించబడిన miRNAలు. గుర్తించబడిన miRNAల యొక్క సంభావ్య లక్ష్య జన్యువులు A. ట్రైకోపోడా జన్యు శ్రేణుల పరంజా అసైన్మెంట్కు వ్యతిరేకంగా psRNATargetని ఉపయోగించి సంబంధిత miRNA లకు వాటి శ్రేణి పరిపూరకాల ఆధారంగా గుర్తించబడ్డాయి. మొత్తంగా, A. ట్రైకోపోడా జన్యువులోని 1219 లక్ష్య సైట్లు గుర్తించబడ్డాయి. దీని నుండి, 941 (77.19%) miRNA చీలికకు సంబంధించినవిగా అంచనా వేయబడ్డాయి మరియు mRNA యొక్క అనువాద అణచివేత ద్వారా 278 (22.81%) పరంజా నియంత్రించబడ్డాయి. అంచనా వేయబడిన miRNAల నుండి, A.trichopodaలో 18కి లక్ష్య క్రమం లేదు.