జర్నల్ ఆఫ్ మైక్రోబియల్ & బయోకెమికల్ టెక్నాలజీ

నైరూప్య

రిటైల్ ఓస్టెర్ టిష్యూస్ నుండి బాక్టీరియల్ DNA వేరుచేయడానికి వివిధ పద్ధతుల పోలిక

కియాన్ జాంగ్, మిన్ డై, యాన్‌హాంగ్ లియు, మిన్ జౌ, జియాన్మింగ్ షి మరియు డాపెంగ్ వాంగ్

గుల్లలు ఫిల్టర్ ఫీడర్‌లు, ఇవి తినే సమయంలో నీటిలో బ్యాక్టీరియాను బయోఅక్యుమ్యులేట్ చేస్తాయి. మొప్పలు మరియు జీర్ణ గ్రంధులతో సహా రిటైల్ ఓస్టెర్ కణజాలాల నుండి సేకరించిన బ్యాక్టీరియా జన్యుసంబంధమైన DNA ను అంచనా వేయడానికి, నాలుగు ఐసోలేషన్ పద్ధతులు ఉపయోగించబడ్డాయి. ఆల్‌మాగ్™ బ్లడ్ జెనోమిక్ DNA (ఆల్‌రన్, షాంఘై, చైనా), మినీబెస్ట్ బాక్టీరియల్ జెనోమిక్ DNA ఎక్స్‌ట్రాక్షన్ కిట్‌లు (తకారా, డాలియన్, చైనా) మరియు ఫినాల్-క్లోరోఫామ్ మరియు మరిగే లైసిస్ పద్ధతులను ఉపయోగించి జెనోమిక్ DNA వెలికితీత జరిగింది. స్పెక్ట్రోఫోటోమీటర్ ఉపయోగించి జన్యుసంబంధమైన DNA యొక్క ఏకాగ్రతను కొలుస్తారు. జన్యుసంబంధమైన DNA యొక్క స్వచ్ఛతను 16S rDNA యొక్క PCR యాంప్లిఫికేషన్ ద్వారా అంచనా వేయబడింది, దీని తర్వాత యాంప్లికాన్ యొక్క క్లోనింగ్ సామర్థ్యాన్ని pMD19-T వెక్టర్‌లోకి నిర్ణయించడం జరిగింది. ఇంకా, విబ్రియో పారాహెమోలిటికస్ కోసం ఒక జత జాతుల-నిర్దిష్ట ప్రైమర్‌లను ఉపయోగించి PCR పరీక్షల ద్వారా బ్యాక్టీరియా DNA నాణ్యతను కూడా విశ్లేషించారు. మా ఫలితాలు రెండు వాణిజ్య కిట్‌లు DNA యొక్క అత్యధిక స్వచ్ఛతను ఉత్పత్తి చేశాయని, కానీ తక్కువ దిగుబడితో ఉన్నాయని చూపించాయి. ఫినాల్-క్లోరోఫామ్ పద్ధతి ఎక్కువ సమయం తీసుకునేది అయినప్పటికీ అత్యధిక దిగుబడిని ఇచ్చింది. మరిగే లైసిస్ పద్ధతి సరళమైనది మరియు ఖర్చుతో కూడుకున్నది; ఏది ఏమైనప్పటికీ, సుసంపన్నత దశను అనుసరించి రిటైల్ నమూనాలలో ఉండే బ్యాక్టీరియా నుండి జన్యుసంబంధమైన DNAను వేరుచేయడానికి మాత్రమే ఇది సరైనది. సుసంపన్నం లేకుండా రిటైల్ ఓస్టెర్ కణజాలాల నుండి జన్యుసంబంధమైన DNA వెలికితీత కోసం రెండు వాణిజ్య కిట్‌లు మంచి అభ్యర్థులు.