జర్నల్ ఆఫ్ ఆక్వాకల్చర్ రీసెర్చ్ & డెవలప్‌మెంట్

నైరూప్య

cDNAలు ష్రిమ్ప్ (పండలోప్సిస్ జపోనికా) నుండి చిటిన్ సింథేస్ ఎన్‌కోడింగ్: మాలిక్యులర్ క్యారెక్టరైజేషన్ మరియు ఎక్స్‌ప్రెషన్ అనాలిసిస్

Md. హసన్ ఉద్దౌలా, అహ్ రాన్ కిమ్, వాన్-గ్యు పార్క్, హ్యూన్-వూ కిమ్*

క్రస్టేసియన్ పెరుగుదల అనేది ఎక్సోస్కెలిటన్ యొక్క ఆవర్తన తొలగింపు, మోల్టింగ్ ద్వారా సంభవిస్తుంది. ఆవర్తన మోల్ట్ సైకిల్‌తో అనుబంధించబడిన చిటిన్ జీవక్రియలో పాల్గొన్న జన్యువులను అర్థం చేసుకోవడం డెకాపాడ్ క్రస్టేసియన్ ఆక్వాకల్చర్‌కు వివిధ అనువర్తనాలకు ముఖ్యమైనది. చిటిన్ సింథేస్ అనేది చిటిన్ బయోసింథటిక్ మార్గంలో ఒక ముఖ్యమైన ఎంజైమ్, ఇది కరిగిన తర్వాత కొత్త క్యూటికల్ సంశ్లేషణలో ప్రధాన పాత్ర పోషిస్తుంది. ఈ అధ్యయనంలో, మేము PCR (పాలిమరేస్ చైన్ రియాక్షన్) ఆధారిత క్లోనింగ్ మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణల కలయిక ద్వారా పండలోప్సిస్ జపోనికా నుండి పూర్తి-నిడివి గల cDNA ఎన్‌కోడింగ్ చిటిన్ సింథేస్ (PajCHS)ని వేరు చేసాము. గుర్తించబడిన PajCHS 1525 అమైనో ఆమ్ల అవశేషాలతో (175 kDa) ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ ప్రోటీన్‌ను ఎన్‌కోడ్ చేస్తుంది. కీటకాల నుండి ఇతర CHSలతో పోల్చి చూస్తే PajCHS మూడు డొమైన్‌లను కలిగి ఉందని వెల్లడించింది: N-టెర్మినల్ డొమైన్ A, ఉత్ప్రేరక డొమైన్ B మరియు C-టెర్మినల్ డొమైన్ C. మూడు సంరక్షించబడిన మూలాంశాలు (EDR, QRRRW మరియు SWGTR) కూడా ఉత్ప్రేరక లోపల మరియు సమీపంలో బాగా సంరక్షించబడ్డాయి. డొమైన్ B, Paj-CHS క్రియాత్మకంగా చురుకుగా ఉందని సూచిస్తుంది. N-టెర్మినల్ మరియు C-టెర్మినల్ డొమైన్‌లలోని ట్రాన్స్‌మెంబ్రేన్ హెలిక్స్‌లోని వైవిధ్యం ప్రతి CHS యొక్క ధోరణి భిన్నంగా ఉండవచ్చని సూచించింది. PajCHS అనేది క్రిమి జాతుల నుండి CHS1 సమూహ సభ్యుల ఆర్థోలాగ్ అని ఫైలోజెనెటిక్ విశ్లేషణ సూచించింది. అయినప్పటికీ, కణజాల వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లు PajCHS ట్రాన్స్క్రిప్ట్ కోసం బాహ్యచర్మం, హెపాటోపాంక్రియాస్, ప్రేగు మరియు గిల్ ప్రధాన ఉత్పత్తి ప్రదేశాలు అని సూచించాయి, ఇది క్రిమి CHS1 నుండి చాలా భిన్నంగా ఉంటుంది. qPCR ఫలితాలు కంటి కొమ్మ అబ్లేషన్ మరియు 20 హైడ్రాక్సీక్డైసోన్ (20E) ఇంజెక్షన్ PajCHS mRNA యొక్క వ్యక్తీకరణ స్థాయిని పెంచాయని చూపించాయి, PajCHS1 యొక్క వ్యక్తీకరణను ఎండోజెనస్ 20E ద్వారా నియంత్రించవచ్చని సూచించింది.