జర్నల్ ఆఫ్ ఫార్మకోజెనోమిక్స్ & ఫార్మాకోప్రొటోమిక్స్

నైరూప్య

పెద్దప్రేగు శోథలో ప్రొఫైల్ నోటి మరియు గట్ మైక్రోబయోమ్‌కు బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విధానం

సమ్మేద్ ఎన్ మండపే

బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ మరియు హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీలలో పురోగతి మానవ సూక్ష్మజీవిని అన్వేషించే మన సామర్థ్యాన్ని గణనీయంగా పెంచింది. 16S రైబోసోమల్ RNA (rRNA) మానవ సూక్ష్మజీవి యొక్క వర్గీకరణ కూర్పును అర్థం చేసుకోవడానికి క్రమం చేయబడింది. ఈ అధ్యయనంలో, 16S rRNA యొక్క బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణ వ్యాధిగ్రస్తుల (క్రోన్'స్ కోలిటిస్ (CC) లేదా అల్సరేటివ్ కొలిటిస్ (UC)) మరియు ప్రక్కనే ఉన్న ఆరోగ్యకరమైన పెద్దప్రేగు నమూనాల నుండి క్రమబద్ధమైన డేటాను మైక్రోబియల్ ఎకాలజీ (QIIME) లోకి పరిమాణాత్మక అంతర్దృష్టులను ఉపయోగించడం ద్వారా నిర్వహించబడింది. ఇంకా, ఈ నమూనాల కోసం జాతి-నిర్దిష్ట సమాచారాన్ని పరిశీలిస్తే, ఆఫ్రికన్-అమెరికన్లు మరియు కాకేసియన్‌ల మధ్య పెద్దప్రేగు మైక్రోబయోమ్ తేడాల పోలిక ప్రదర్శించబడింది. ఫలితంగా, రెండు వందల-ఎనిమిది వేర్వేరు బ్యాక్టీరియా జాతులు వర్గీకరించబడ్డాయి. అయినప్పటికీ, జాతుల స్థాయిలో యాభై-మూడు బ్యాక్టీరియా మాత్రమే వివరించబడింది. వ్యాధిగ్రస్తులైన CC మరియు UC నమూనాలలో హాని చేయని బ్యాక్టీరియా యొక్క భిన్నం ప్రక్కనే ఉన్న ఆరోగ్యకరమైన పెద్దప్రేగు నమూనాల నుండి భిన్నంగా ఉంటుంది. అదనంగా, వ్యాధిగ్రస్తుల నమూనాల మైక్రోబయోమ్‌లో ఫైలా ఫర్మిక్యూట్స్ (స్ట్రెప్టోకోకస్, స్టెఫిలోకాకస్, పెప్టోస్ట్రెప్టోకోకస్) మరియు ఫ్యూసోబాక్టీరియా (ఫ్యూసోబాక్టీరియం)కి చెందిన నోటి బ్యాక్టీరియా ఆధిపత్యం చెలాయిస్తుంది. ఫలితాలు ఆఫ్రికన్-అమెరికన్లు మరియు కాకేసియన్ల మధ్య సూక్ష్మజీవిలో తేడాలను కూడా చూపించాయి, ఇది ఆరోగ్య అసమానతలపై సంభావ్య పరిశోధన దృష్టిని సూచిస్తుంది.