బాక్టీరియాలజీ & పారాసిటాలజీ జర్నల్

నైరూప్య

యాంటీబాడీ క్రాస్-రియాక్టివిటీకి ప్రిడిక్టర్‌గా యాంటిజెనిక్ స్ట్రక్చరల్ సిమిలారిటీ

క్రిస్టోఫర్ A. బ్యూడోయిన్*, టామ్ L. బ్లండెల్

బాక్టీరియా మరియు పరాన్నజీవి వ్యాధికారక వంటి విదేశీ ఆక్రమణదారులను తటస్థీకరించడానికి పని చేసే అనుకూల రోగనిరోధక వ్యవస్థలో యాంటీబాడీస్ ఒక ముఖ్యమైన భాగం. అయినప్పటికీ, B-సెల్ ఎపిటోప్‌లు ఇతర ప్రోటీన్ ప్రాంతాల నుండి వాటి సాధారణ విడదీయలేని కారణంగా అంచనా వేయడం కష్టం. ఎపిటోప్ ప్రిడిక్షన్ టూల్స్ గతంలో ఎక్కువగా అమైనో యాసిడ్ సీక్వెన్స్ సారూప్యతపై ఆధారపడి ఉన్నాయి; అయినప్పటికీ, ఎపిటోప్ ప్రిడిక్షన్ అల్గారిథమ్‌లలో త్రిమితీయ ప్రోటీన్ నిర్మాణ విశ్లేషణలను అమలు చేయడం ద్వారా గుర్తించే ఖచ్చితత్వం పెరుగుతుందని చూపబడింది. ఇంకా, క్రాస్-రియాక్టివ్ యాంటీబాడీలను బంధించే సామర్థ్యం కోసం యాంటిజెనిక్ ప్రోటీన్ల మధ్య నిర్మాణ పోలికలు సాహిత్యంలో విస్తృతంగా అన్వేషించబడలేదు. ఇటీవలి అధ్యయనాలు యాంటీబాడీ క్రాస్‌రియాక్టివిటీని అంచనా వేయడంలో భాగస్వామ్య ఎపిటోప్ నిర్మాణాలను చూడటం యొక్క ప్రయోజనాన్ని సూచించాయి, ఇది అంటు వ్యాధికారకాలు మరియు సంక్రమణ తర్వాత ప్రేరేపించబడిన ఆటో ఇమ్యూన్ వ్యాధుల మధ్య క్రాస్-ఇమ్యూన్‌పై వెలుగునిస్తుంది. అందువల్ల, ఇక్కడ, భాగస్వామ్య ఎపిటోప్‌లను గుర్తించడంలో నిర్మాణాత్మక సారూప్యత పోలికలను చేర్చడం వల్ల కలిగే సంభావ్య ప్రభావం చర్చించబడింది. త్రిమితీయ గణన ప్రోటీన్ మోడలింగ్ పద్ధతుల ద్వారా పెద్ద మొత్తంలో నిర్మాణాత్మక సమాచారం నిర్ణయించబడటంతో, ఈ విశ్లేషణలను నిర్వహించగల సామర్థ్యం మరింత సాధ్యమవుతోంది.