జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

rpoB మరియు katG జన్యువులలో కోడాన్ యొక్క విశ్లేషణ మరియు మ్యుటేషన్ మరియు RNA β పాలిమరేస్ సబ్యూనిట్ ద్వారా RIF బైండింగ్ మోడల్ యొక్క బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ అధ్యయనం: మెరౌక్ జనరల్ హాస్పిటల్-ఇండోనేషియాలో క్షయవ్యాధి రోగులలో అధ్యయనం

కవులూరు హెచ్‌ఎస్‌ఐ మరియు ఎంగిలి వై

TB రోగుల చికిత్స సాధారణంగా రిఫాంపిన్ (RIF) మరియు ఐసోనియాజిడ్ (INH)తో పాటు స్ట్రెప్టోమైసిన్ లేదా పైరజినామైడ్‌తో కలిపి మూడు రకాల యాంటిట్యూబర్‌క్యులోసిస్ మందులను అందించడం ద్వారా జరుగుతుంది. RIF ప్రతిఘటన అనేది RNA పాలిమరేస్ β-సబ్యూనిట్‌ను ఉత్పత్తి చేసే జన్యువు అయిన rpoB జన్యువు యొక్క మ్యుటేషన్‌కు ఆపాదించబడింది మరియు INH నిరోధకత ఎక్కువగా katG జన్యువు యొక్క మ్యుటేషన్ కారణంగా ఉంటుంది. ఈ అధ్యయనం యొక్క లక్ష్యం సంబంధిత జన్యువులతో MDR-TB యొక్క అనుబంధంపై సమాచారాన్ని పొందడం, అలాగే మెరౌక్‌లోని క్షయవ్యాధి రోగులలో మైకోబాక్టీరియం ట్యూబర్‌క్యులోసిస్ జన్యురూపం కలయికపై సమాచారాన్ని పొందడం. చాలా వరకు MDRTB ఐసోలేట్‌లు ఇతర క్షయవ్యాధి నిరోధక మందులకు నిరోధకతను కలిగి ఉన్నాయని మేము ఇక్కడ నివేదించాము మరియు rpoB526 మరియు rpoB531 (రెండు వైపులా సంభవించే ఉత్పరివర్తనలు/ఈ ప్రదేశం దాదాపు ఎల్లప్పుడూ కలిసి జరుగుతాయి) యొక్క మ్యుటేషన్ ఫ్రీక్వెన్సీ దాదాపు ఒకే విధంగా ఉంటుంది కానీ katG315 మ్యుటేషన్ ఇందులో ఉంది కేవలం 16 ఐసోలేట్‌లు (katG315లో సంభవించే ఉత్పరివర్తనాల సంఖ్య ఇన్ కంటే తక్కువగా ఉంటుంది rpoB526 మరియు rpoB531). C1363A న్యూక్లియోటైడ్ మార్పులు ఆరు యాంటీట్యూబర్‌క్యులోసిస్ ఔషధాల యొక్క సున్నితమైన మైకోబాక్టీరియం క్షయవ్యాధిలో అన్ని rpoB ఉత్పరివర్తనలు ప్రతిఘటనను కలిగించలేదని చూపించాయి. ఈ దృగ్విషయం ఆధారంగా, MDR-TB జాతులు ఏర్పడే విధానం rpoB మ్యుటేషన్‌తో మొదలవుతుందని, ఆ తర్వాత katG యొక్క మ్యుటేషన్‌తో ప్రారంభమవుతుందని ప్రతిపాదించవచ్చు. ఈ అధ్యయనం rpoBని ప్రభావితం చేసే రిఫాంపిన్ వంటి ఒక జన్యువును మాత్రమే ప్రభావితం చేసే ఔషధానికి ప్రతిఘటన యొక్క యంత్రాంగం, katGతో పాటు ఇతర జన్యువులను ప్రభావితం చేసే ఐసోనియాజిడ్ వంటి అనేక జన్యువులను ప్రభావితం చేసే యాంటీ ట్యూబర్క్యులస్ ఔషధాల కంటే సులభంగా నియంత్రించబడుతుందని నిరూపిస్తుంది.