జర్నల్ ఆఫ్ ప్లాంట్ పాథాలజీ & మైక్రోబయాలజీ

నైరూప్య

నల్ల మిరియాలు యొక్క ఫుట్ రాట్ వ్యాధికి కారణమైన ఫైటోఫ్తోరా క్యాప్సిసి నుండి పూర్తి పొడవు ఎలిసిటిన్ జన్యువు యొక్క విస్తరణ, క్లోనింగ్ మరియు సిలికోలో అంచనా

విజేష్ కుమార్ IP, రీనా N, ఆనందరాజ్ M, ఈపెన్ SJ, జాన్సన్ GK మరియు వినీత KB

ఎలిసిటిన్స్ అనేది ఫైటోఫ్తోరా ద్వారా స్రవించే చిన్న ప్రోటీన్ల కుటుంబం, ఇది సోకిన మొక్కలలో ఆకు నెక్రోసిస్‌ను ప్రేరేపిస్తుంది. ఇక్కడ, మేము P. క్యాప్సిసి నుండి ఎలిసిటిన్ జన్యువు యొక్క క్లోనింగ్‌ను నివేదిస్తాము, ఇది ఓమైసెట్ ప్లాంట్ పాథోజెన్, ఇది విస్తృత శ్రేణి హోస్ట్ ప్లాంట్‌లకు గణనీయమైన నష్టాన్ని కలిగిస్తుంది. ఇతర ఫైటోఫ్థోరా జీవుల యొక్క తెలిసిన ఎలిసిటిన్ జన్యువుల నుండి వాటి సంరక్షించబడిన మూలాంశాల ఆధారంగా రూపొందించబడిన ప్రైమర్‌లను ఉపయోగించి ఎలిసిటిన్ సీక్వెన్స్ విస్తరించబడింది. PCR విస్తరించిన ఉత్పత్తి పరిమాణం 256 bp పొడవు మరియు క్రమం చేయబడిన ఉత్పత్తి యొక్క BLAST విశ్లేషణ P. క్యాప్సిసి యొక్క ఆల్ఫా-ఎలిసిటిన్ సీక్వెన్స్‌లతో ఖచ్చితమైన సరిపోలికను చూపించింది. తదనంతరం, జన్యువుకు వ్యతిరేకంగా విస్తరించిన ఉత్పత్తిని ప్రశ్నించడం ద్వారా P. క్యాప్సిసి యొక్క జన్యు శ్రేణి సమాచారం నుండి ఎలిసిటిన్ యొక్క పూర్తి జన్యువును వర్గీకరించే ప్రయత్నం జరిగింది. పూర్తి జన్యువుకు వ్యతిరేకంగా స్థానిక BLAST శోధన మొత్తం కోడింగ్ క్రమాన్ని గుర్తించింది. తదుపరి శ్రేణి విశ్లేషణ సంరక్షించబడిన 6 సిస్టీన్ అవశేషాలతో ప్రమోటర్ సీక్వెన్స్, ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ స్టార్ట్ సైట్, లీడర్ సిగ్నల్ సీక్వెన్స్ మరియు కోర్ ఎలిసిటిన్ డొమైన్‌లను గుర్తించింది. అదనంగా, క్యాప్సీసిన్ యొక్క త్రిమితీయ నిర్మాణం నమూనా చేయబడింది మరియు స్టెరాల్ మరియు క్యాప్సిసిన్ యొక్క బైండింగ్ అనుబంధాన్ని పరమాణు డాకింగ్ ఉపయోగించి అధ్యయనం చేశారు. అభివృద్ధి చెందిన మోడల్ టైర్ 47కి బలమైన బంధాన్ని అంచనా వేసింది.