జర్నల్ ఆఫ్ డేటా మైనింగ్ ఇన్ జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్

నైరూప్య

నవల సిట్రస్ లెప్రోసిస్ వైరస్ సైటోప్లాస్మిక్ టైప్ 2 డిస్కవరీపై ఒక కేస్ స్టడీ చిన్న RNA లైబ్రరీలను నెక్స్ట్ జనరేషన్ సీక్వెన్సింగ్ మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్ అనలైజ్‌ల ద్వారా ఉపయోగించడం

అవిజిత్ రాయ్, జోనాథన్ షావో, జాన్ ఎస్ హార్టుంగ్, విలియం ష్నీడర్ మరియు RH బ్రలన్స్కీ

"నెక్స్ట్-జనరేషన్" సీక్వెన్సింగ్ (NGS)గా సూచించబడే వినూత్న సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీ యొక్క ఆగమనం, ముందస్తు జ్ఞానం లేకుండా 'తెలియని' మరియు 'తెలియని' వైరల్ వ్యాధికారకాలను గుర్తించడానికి ఒక కొత్త విధానాన్ని అందిస్తుంది. సోకిన హోస్ట్‌లో చాలా తక్కువ టైటర్‌లలో సంభవించినప్పుడు కూడా మొక్కల వైరస్‌ల జన్యువులు వేగంగా నిర్ణయించబడతాయి. ఈ పద్ధతి RNA సైలెన్సింగ్ హోస్ట్ డిఫెన్స్ ద్వారా ఉత్పత్తి చేయబడిన చిన్న RNA అణువుల 18-35 న్యూక్లియోటైడ్‌ల జనాభా యొక్క భారీ సమాంతర శ్రేణిపై ఆధారపడి ఉంటుంది. రసాయన శాస్త్రాలలో మెరుగుదలలు, బయోఇన్ఫర్మేటిక్ సాధనాలు మరియు ఇంజనీరింగ్‌లో పురోగతి NGS ఖర్చులను తగ్గించాయి, దాని యాక్సెసిబిలిటీని పెంచాయి మరియు మొక్కల వైరాలజీ రంగంలో దాని అనువర్తనాన్ని ప్రారంభించాయి. ఈ సమీక్షలో, నవల సైటోప్లాస్మిక్ సిట్రస్ లెప్రోసిస్ వైరస్ (CiLV) యొక్క ఆవిష్కరణ కోసం మాలిక్యులర్ బయాలజీ మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్ టూల్స్ యొక్క అప్లికేషన్‌తో కలిపి ఇల్యూమినా GA IIX ప్లాట్‌ఫారమ్ యొక్క వినియోగాన్ని మేము చర్చిస్తాము. ఈ కొత్త వైరస్ CiLV యొక్క విలక్షణమైన లక్షణాలను ఉత్పత్తి చేసింది కానీ గతంలో వివరించిన వైరస్ కోసం సెరోలాజికల్ లేదా PCR-ఆధారిత పరీక్షలతో గుర్తించబడలేదు. అసంపూర్ణ జన్యు వనరులతో కూడిన ముఖ్యమైన ఉద్యాన పంట అయిన స్వీట్ ఆరెంజ్ (సిట్రస్ సినెన్సిస్)లో తక్కువ టైటర్‌లో కొత్త వైరల్ జన్యువు కూడా ఉంది. ఉద్యాన పరిశోధనలో ఇది ఒక సాధారణ పరిస్థితి మరియు ఈ విధానం యొక్క విస్తృత వినియోగానికి ఉదాహరణను అందిస్తుంది. నవల వైరస్‌ల ఆవిష్కరణతో పాటు, వైరల్ ఎవల్యూషన్ మరియు ఎకాలజీ అధ్యయనాలకు మరియు వైరల్ మరియు హోస్ట్ ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్‌ల మధ్య పరస్పర చర్యలకు సీక్వెన్స్ డేటా ఉపయోగపడుతుంది.